Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT25Q7Z3Z0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT25Q7Z3Z0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms