Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q71RC1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q71RC1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q71RC1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q71RC1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q71RC1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q71RC1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q71RC1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q71RC1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms