Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP6Q6ZN66 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms