Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC171Q6TFL3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms