Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC1Q6TDU7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms