Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOA5Q6Q788 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOA5Q6Q788 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms