Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAF7Q6Q0C0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms