Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CTR9Q6PD62 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTR9Q6PD62 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms