Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CSAG1Q6PB30 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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