Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H3F3CQ6NXT2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3F3CQ6NXT2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms