Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHBDD2Q6NTF9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RHBDD2Q6NTF9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms