Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3L3Q68CJ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms