Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF123Q5XPI4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms