Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD4Q5VX71 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms