Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms