Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPRD2Q5VT52 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPRD2Q5VT52 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms