Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRIP1Q5VSL9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRIP1Q5VSL9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms