Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q5VSD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q5VSD8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q5VSD8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q5VSD8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q5VSD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q5VSD8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q5VSD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms