Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms