Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SAMD5Q5TGI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms