Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CC2D1BQ5T0F9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CC2D1BQ5T0F9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms