Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C10orf55Q5SWW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C10orf55Q5SWW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms