Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A13Q5J8X5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms