Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms