Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TDRD12Q587J7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms