Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A3Q4VXF1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM74A3Q4VXF1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM74A3Q4VXF1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms