Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPDYE2Q495Y8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE2Q495Y8 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms