Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS9Q3SYG4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms