Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00303Q3SY05 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms