Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TTLL9Q3SXZ7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TTLL9Q3SXZ7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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