Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
KRTAP20-2Q3LI61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms