Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNPY1Q3B7I2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNPY1Q3B7I2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms