Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A8Q2Y0W8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms