Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSR1Q2NL82 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSR1Q2NL82 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms