Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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SGSM1Q2NKQ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGSM1Q2NKQ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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