Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms