Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KNOP1Q1ED39 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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