Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPRNQ16849 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms