Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UPP1Q16831 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UPP1Q16831 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms