Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
DUSP6Q16828 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP6Q16828 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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