Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTN1Q16799 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms