Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK4Q16654 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDK4Q16654 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms