Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF239Q16600 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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