Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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