Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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CRY1Q16526 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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CRY1Q16526 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRY1Q16526 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRY1Q16526 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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