Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPE65Q16518 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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