Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PRR4Q16378 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PRR4Q16378 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms