Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC6Q16204 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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