Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIX1Q15475 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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