Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNN3Q15417 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNN3Q15417 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms