Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTF1Q15361 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTF1Q15361 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms